Over Ons
Onderzoeksgroepen
Vrienden
Terug naar onderzoeksgroepen
De De Laat groep bestudeert genoomstructuur en -functie in ontwikkeling en ziekte, en ontwikkelt DNA-sequencingmethoden voor verbeterde klinische diagnostiek.
In het genoom van een zoogdier bevinden zich miljoenen niet-coderende sequenties. Deze hebben een mogelijke functie als transcriptiefactor die de genexpressie kunnen verhogen of juist verlagen. De De Laat groep probeert te begrijpen hoe deze duizelingwekkende hoeveelheid genetisch materiaal functioneel is gekoppeld aan de ongeveer twintigduizend bestaande genen, zodat hun expressie zich voltrekt in de goede tijd en plaats, en hoe fouten in dit proces kan leiden tot ziekte.
Met dank aan het werk van vele onderzoekers, waaronder die uit onze eigen groep, wordt de vorm van het genoom nu gezien als een belangrijke speler bij de controle van het aflezen van genetisch materiaal. Vooral de Chromosome Conformation Capture (3C)-technologieën hebben bijgedragen aan dit gegeven, en hebben een hiërarchische organisatie van het genoom aan het licht gebracht, die samenhangt met de regulatie van genexpressie. Enhancers, stukjes niet-coderende informatie in het genoom die de expressie van genen reguleren, beïnvloeden hun doelgenen door middel van 3D-chromatinelooping. Deze enhancers en loops zijn geordend in topologically associating domains (’topologisch geassocieerde domeinen’, TADs): micro-omgevingen waarin genen en regulatoire elementen met elkaar in contact komen. In een groter verband clusteren deze TADs in actieve (A) en inactieve (B) compartimenten. Deze kunnen ook weer worden opgedeeld in subcompartimenten met elk een afzonderlijke opbouw van chromatine.
Het doel van ons onderzoek is het begrijpen van het verband tussen de structuur en functie van het genoom in gezonde en zieke zoogdieren. Wouter de Laat Groepsleider
Het doel van ons onderzoek is het begrijpen van het verband tussen de structuur en functie van het genoom in gezonde en zieke zoogdieren.
We gebruiken en ontwikkelen nieuwe genomics-benaderingen en berekeningsmethodes op basis van Next Generation Sequencing en Oxford Nanopore Single Molecule Sequencing (a)om sneller de driedimensionale structuur van het genoom, en de invloed op genregulatie te begrijpen, en (b) voor betere klinische DNA-diagnostiek.
Het grootste deel van ons onderzoek is gebaseerd op het begrijpen van genregulatie bij ontwikkeling en ziekte (b.v. kanker) en hoe dit wordt gecontroleerd door enhancers, niet-coderende regulatoire DNA-elementen, die op het lineaire chromosoom vaak niet in de buurt van de bijbehorende genen liggen. Eerder waren wij de eersten die de 3C-technologie aanpasten voor onderzoek naar DNA-topologie bij zoogdieren, en die aantoonden dat enhancers en promoters die ver van elkaar liggen elkaar beïnvloeden bij het reguleren van genen (Tolhuis, Mol Cell 2002; Palstra, Nat Genetics 2003). We waren ook de eerste onderzoeksgroep die aantoonden dat transcriptiefactoren chromatineloops mediëren (Drissen, Genes and Dev 2004). In 2006 waren wij de eersten die aantoonden dat CTCF chromatineloops vormt (Splinter, Genes and Dev 2006) en publiceerden wij de inmiddels veel gebruikte 4C-technologie (Simonis, Nat Genetics 2006).
Rinzema NJ, Sofiados k, [...], de Laat W
Download|2022
Krijger PHL, Hoek TA, [...], de Laat W, Tanenbaum M
Download|2021
Vos ESM, Valdes-Quezada C, Huang Y [...], de Laat W
Allahyar A, Pieterse M, [...], de Laat W
Tjalsma SJD, de Laat W
Huang Y, Neijts R, de Laat W
Download|2020
Vermeulen C, Allahyar A [...], de Ridder J, de Laat W
Krijger PHL, Geeven G, [...], de Laat W
Download|2019
Redolfi J, Zhan Y, Valdes-Quezada C, [...], de Laat W, Giorgetti L
Allahyar A, Vermeulen C, [...], de Ridder J, de Laat W
Download|2018
Vermeulen C, Geeven G, [...], de Laat W
Download|2017
Krijger PHL, Di Stefano B, [...], de Laat W, Graf T
Download|2016
Wijchers PJ, Krijger PHL, [...], de Laat W
de Wit E, Vos ESM, [...], de Laat W
Download|2015
de Vree PJP, de Wit E, [...], de Laat W
Download|2014
de Wit E, Bouwman BA, [...], de Laat W
Download|2013
van de Werken H, Landan G, [...], de Laat W
Download|2012
Simonis M, Klous P, [...], de Laat W
Download|2009
Splinter E, Heath H, [...], de Laat W
Download|2006
Palstra RJ, Tolhuis B, Splinter E, Nijmeijer R, Grosveld F, de Laat W
Download|2003
Tolhuis B, Palstra RJ, Splinter E, Grosveld F, de Laat W
Download|2002
Wouter de Laat is groepsleider bij het Hubrecht Institute en hoogleraar Biomedische Genomica aan het Universitair Medisch Centrum Utrecht. Zijn onderzoek richt zich op regulatie van epigenetica en genexpressie. Daarvoor heeft De Laat technologieën ontwikkeld waarmee hij kan bestuderen hoe de driedimensionale structuur van het genoom de transcriptieregulatie beïnvloedt. De Laat en zijn team willen de relatie tussen de structuur en de functie van het genoom begrijpen. Een ander aandachtspunt is klinische diagnostiek. De onderzoeksgroep van Wouter de Laat ontwikkelt DNA-sequencing technologie voor klinische toepassingen, zoals de diagnostiek van kanker en niet-invasieve prenatale diagnostiek van overerfbare ziekten. Wetenschappelijke opleiding en posities
Lees minder
Andere activiteiten
Curriculum Vitae
Contact
Group Leader
Technician
Postdoc
PhD Student
Show all group members