de Laat: Biomedische genetica

Terug naar onderzoeksgroepen

De De Laat groep bestudeert genoomstructuur en -functie in ontwikkeling en ziekte, en ontwikkelt DNA-sequencingmethoden voor verbeterde klinische diagnostiek.

Organisatie en genexpressie in de celkern

In het genoom van een zoogdier bevinden zich miljoenen niet-coderende sequenties. Deze hebben een mogelijke functie als transcriptiefactor die de genexpressie kunnen verhogen of juist verlagen. De De Laat groep probeert te begrijpen hoe deze duizelingwekkende hoeveelheid genetisch materiaal functioneel is gekoppeld aan de ongeveer twintigduizend bestaande genen, zodat hun expressie zich voltrekt in de goede tijd en plaats, en hoe fouten in dit proces kan leiden tot ziekte.

Key publicationsView all publications

American Journal of Human Genetics 101,1-14.

Download|2017

Cell Stem Cell, 18(5):597-610.

Download|2016

Molecular Cell, 61(3):461-73.

Download|2016

CTCF binding polarity determines chromatin looping.

de Wit E, Vos ESM, [...], de Laat W

Mol. Cell. 60(4):676-84.

Download|2015

Nature Biotechnology 32(10):1019-25.

Download|2014

Nature 501(7466):227-31.

Download|2013

Nature Methods, 9:969-72.

Download|2012

Genes & Dev 20: 2349-2354.

Download|2006

The beta-globin nuclear compartment in development and erythroid differentiation.

Palstra RJ, Tolhuis B, Splinter E, Nijmeijer R, Grosveld F, de Laat W

Nature Genetics 35, 190-194.

Download|2003

Looping and interaction between hypersensitive sites in the active beta-globin locus.

Tolhuis B, Palstra RJ, Splinter E, Grosveld F, de Laat W

Molecular Cell 10: 1453–1465,

Download|2002

Groepsleider

Wouter de Laat

Wouter de Laat is groepsleider bij het Hubrecht Institute en hoogleraar Biomedische Genomica aan het Universitair Medisch Centrum Utrecht. Zijn onderzoek richt zich op regulatie van epigenetica en genexpressie. Daarvoor heeft De Laat technologieën ontwikkeld waarmee hij kan bestuderen hoe de driedimensionale structuur van het genoom de transcriptieregulatie beïnvloedt. De Laat en zijn team willen de relatie tussen de structuur en de functie van het genoom begrijpen. Een ander aandachtspunt is klinische diagnostiek. De onderzoeksgroep van Wouter de Laat ontwikkelt DNA-sequencingtechnologie voor klinische toepassingen, zoals de diagnostiek van kanker en niet-invasieve prenatale diagnostiek van overerfbare ziekten.

Wetenschappelijke opleiding en posities

Andere activiteiten


Groepsleden

Wouter de Laat

Group Leader

Marjon Verstegen

Technician

Diana Braat

Technician

Roel Neijts

Postdoc

Peter Krijger

Postdoc

Amin Allahyar

Postdoc

Ruiqi Han

Postdoc

Konstantinos Sofiadis

Postdoc

Niels Rinzema

PhD Student

Yike Huang

PhD Student

Sjoerd Tjalsma

PhD Student

Iwan Vaandrager

PhD Student

Anna Felder

PhD Student

Qian Liu

Guest

Show all group members

Open PhD position

Description of the project: The PhD student will be part of ENHPATHY, a multidisciplinary science consortium created in the frame of the Marie Sklodowska-Curie actions (MSCA)-ITN-ETN European Training Networks call and regrouping 12 academic and 3 non-academic European organisations in the continuum of basic, translational and clinical research on enhancers and associated diseases. The project will characterize the functioning and impact of novel key topological factors on long-range regulatory and architectural chromatin interactions and hub formation, using state-of-the-art protein depletion, chromatin topology and microscopy technologies.

Requirements: We are seeking outstanding PhD candidates (Master of Science or equivalent qualification) with a strong background in cell biology, genetics and/or bioinformatics. The candidate should be passionate about biology, curious, and motivated to work in an ambitious and collaborative environment. Fluency in English is required. Per EU ETN mobility requirement, the candidate has resided no more than 12 months in the Netherlands in the last 3 years. The application should include a letter of motivation, a CV with two references, and a short summary of your Master thesis.