Bothma: Dynamiek van transcriptie

Terug naar onderzoeksgroepen

De Bothma groep onderzoekt hoe niet-coderende regio’s van het genoom genexpressie reguleren tijdens de ontwikkeling, door het proces van transcriptie onder de microscoop zichtbaar te maken met de resolutie van individuele moleculen.

Een van de blijvende mysteries in de natuur is de vraag hoe een individuele cel in een embryo zijn genoom interpreteert, zodat deze cel zich kan specialiseren in de vele verschillende celtypes waaruit een dier is opgebouwd. Het ontrafelen van dit mysterie belooft niet alleen nieuwe inzichten in ontwikkelingsstoornissen en kanker, maar ook het blootleggen van de organisatorische principes van het leven. Ook al hebben we alle regulerende factoren en niet-coderende regio’s van het genoom die celtypes karakteriseren ontdekt, we weten nog steeds niet hoe al deze factoren samenkomen om een dier te vormen. Een van de belangrijkste redenen voor deze kloof in onze kennis is dat we deze processen tot nu toe niet konden visualiseren in de tijd.

Key publicationsView all publications

Cell 173(7): 181-1822

Download|2018

eLIFE: e07956

Download|2015

PNAS 111(29): 10598-10603

Download|2014

Current Biology 21(18): 1571–1577

Download|2011

Device-Quality Electrically Conducting Melanin Thin Films

Bothma JP, De Boor J, [...] Schwenn PD and Meredith P

Advanced Materials 20(18): 3539–3542

Download|2008

Groepsleider

Jacques Bothma

Jacques Bothma begon zijn wetenschappelijke carriere in Australie, waar hij zijn Bachelor of Science in de natuurkunde behaalde aan de Universiteit van Queensland. Hij besloot vervolgens over te stappen naar biologie en een PhD project te doen in biofysica aan de Universiteit van Californië, Berkeley, in de groep van Mike Levine. Hier ontrafelde hij genetische mechanismes die zorgen voor een robuuste en gecoördineerde inzet van genexpressie tijdens de ontwikkeling. Vervolgens bleef hij in Berkeley voor zijn postdoc. Tijdens deze postdoc verrichte hij baanbrekend werk in nieuwe en kwantitatieve live-imaging benadering voor het zichtbaar maken van transcriptie en gen-regulerende netwerken in embryo’s. Dit werk deed hij in het lab van Hernan Garcia. Bothma begint als groepsleider aan het Hubrecht Institute in November 2019 en zal hier onderzoeken hoe niet-coderende delen van het genoom genexpressie controleren tijdens de ontwikkeling en ziekte. Hij zal hiervoor de nieuwste live-imaging technieken en kwantitatieve benaderingen gebruiken.


Groepsleden

Jacques Bothma

Group Leader

Video's

Job openings

Technician

Research group

Bothma group

Start date

01/12/2019

Locatie

Utrecht Science Park, De Uithof.

Period

Full time