Knipscheer: Genome Maintenance

Terug naar onderzoeksgroepen

De Knipscheer groep bestudeert de moleculaire mechanismen van DNA-replicatie en -reparatie.

Cellulaire processen die de integriteit van ons genoom bewaken zijn cruciaal voor het voorkomen van ziekten met een genetische basis, zoals kanker. De Knipscheer groep is geïnteresseerd in de moleculaire details achter deze processen. Op dit moment focust de groep zich op toxische DNA-laesies, interstrand crosslinks (ICL’s), hoe deze worden gerepareerd en hoe stabiele secundaire DNA-structuren (G-quadruplexes) worden opgelost. De Knipscheer groep bestudeert deze processen in de context van actieve DNA-replicatie en gebruikt daarvoor extracten van Xenopus-eieren, een onderzoeksmodel voor DNA-replicatie van gewervelden in vitro. Dit model staat onderzoekers toe om ICL-reparatie en G-quadruplex-replicatie te bestuderen in een reageerbuisje, en daarmee inzicht te krijgen in de moleculaire systemen achter deze processen.

Selected publicationsView all publications

Alcohol-derived DNA interstrand crosslinks are repaired by two distinct mechanisms.

Hodskinson MR*, Bolner A*, Sato K, […] Kind J, Chin J, Patel KJ#, Knipscheer P#

Nature. 579(7800):603-608

Download|2020

HSF2BP Negatively Regulates Homologous Recombination in DNA Interstrand Crosslink Repair.

Sato K*, Brandsma I*, van Rossum-Fikkert SE, […] Knipscheer P#, Kanaar R#, Zelensky AN#

Nucleic Acid Research. 48(5);2442-2456

Download|2020

Nucleic Acid Research. 18;47(5):2377-2388

Download|2020

EMBO J. 36(14):2034-2046

Download|2017

FANCJ promotes DNA synthesis through G-quadruplex structures.

Castillo Bosch P, Segura-Bayona S, […] Tijsterman M#, Knipscheer P#

EMBO J. 33(21):2521-33

Download|2014

Mol Cell. 54(3):460-71

Download|2014

HSF2BP Interacts with a Conserved Domain of BRCA2 and Is Required for Mouse Spermatogenesis.

Brandsma I, Sato K, […] Knipscheer P#, Kanaar R#, Zelensky AN#

Cell Reports. 25;27(13):3790-3798

Download|2019

Dev Biol. 428(2):300-309

Download|2017

Methods Mol Biol. 920:221-43

Download|2012

Science. 326:1698-1701

Download|2009

Mechanism of replication-coupled DNA interstrand crosslink repair.

Räschle M, Knipscheer P, […] Schärer OD, Walter JC

Cell. 134:969-980

Download|2008

Groepsleider

Puck Knipscheer

Puck Knipscheer is groepsleider bij het Hubrecht Institute, bijzonder hoogleraar Biochemie van Genoomonderhoud bij het Leids Universitair Medisch Centrum en Oncode Investigator. Haar groep onderzoekt de manier waarop DNA interstrand crosslinks (ICL’s), een soort DNA-schade, worden gerepareerd en hoe secundaire DNA-structuren (G-quadruplexes) worden ontleed. Deze processen zijn belangrijk voor het behouden van de stabiliteit van ons genoom en het voorkomen van ziekten zoals kanker. De Knipscheer groep onderzoekt deze processen tijdens de actieve DNA-replicatie bij extractie van de eitjes van Xenopus laevis. Dankzij deze extracten is het mogelijk om onderzoek te doen naar deze processen onder fysiologische omstandigheden, wat het mogelijk maakt om deze belangrijke mechanismen in detail te bestuderen.

Wetenschappelijke opleiding en posities

Prijzen


Groepsleden

Puck Knipscheer

Group Leader

Alexander Verkennis

Technician

Diana Braat

Technician

Koichi Sato

Postdoc

Roxanne van der Sluijs

PhD Student

Themistoklis Liolios

PhD Student

Lars ter Morsche

PhD Student

Victoria Cruz

researcher

Show all group members

Job openings

PostDoc - 38 hours p/w

Research group

Knipscheer groep

Start date

01/05/2024

Locatie

Utrecht Science Park

PhD student - Group Knipscheer/Mattiroli - 38 hours p/w

Research group

Knipscheer groep

Start date

01/05/2024

Locatie

Utrecht Science Park

PhD student - 38 hours p/w

Research group

Knipscheer groep

Start date

01/05/2024

Locatie

Utrecht Science Park

Research Technician - 36/38 hours p/w

Research group

Knipscheer groep

Start date

01/05/2024

Locatie

Utrecht Science Park