Sonnen: Signaaldynamiek

Terug naar onderzoeksgroepen

De Sonnen-groep onderzoekt hoe signalerings pathways informatie doorgeven om de ontwikkeling en homeostase van multicellulaire systemen te regelen.

Figuur 1: Overdracht van biologische informatie met signaleringsdynamiek. Informatie kan worden gecodeerd in de dynamiek van een signaleringsroute, bijvoorbeeld in oscillaties. Het signaal kan worden gedecodeerd door het signaal uit te lezen in een statische (bijvoorbeeld absoluut niveau op het tijdpunt gemarkeerd met een stippellijn) of op een dynamische manier.

Signalerings pathways coördineren meercellige systemen en bepalen beslissingen over het lot van cellen. Op deze manier zijn ze absoluut essentieel voor het begeleiden van embryonale processen zoals ontwikkeling, homeostase bij volwassenen, regeneratie of de immuunrespons. Als er mutaties in signaalwegcomponenten optreden, kan dit bijvoorbeeld leiden tot ontwikkelingsmisvormingen en ziekte-ontwikkeling zoals kanker. Daarom is een van de lang bestaande vragen op het gebied van meercellige biologie hoe signaleringsroutes functioneren. Eerder is aangetoond dat biologische informatie kan worden gecodeerd in de dynamiek (d.w.z. de tijdelijke verandering) van een signaal. Het grootste deel van onze kennis tot nu toe is echter afkomstig van onderzoeken met single cellen (Sonnen en Aulehla 2014). Met nieuwe technologische vooruitgang zijn we nu in het stadium om te bestuderen hoe signaaldynamiek de ontwikkeling en de weefselhomeostase op multicellulair niveau regelt (Sonnen et al. Cell 2018, Sonnen en Merten, Dev Cell 2019). Ons werk is gericht op het begrijpen van de functie en het mechanisme van dynamische signaalcodering in multicellulaire systemen, zowel tijdens de embryonale ontwikkeling als weefselhomeostase bij volwassenen.

Zie ook onze Sonnen Lab website voor meer informatie.

Key publicationsView all publications

Single-cell and spatial transcriptomics reveal somitogenesis in gastruloids

SC v d Brink, A Alemany, V van Batenburg, N Moris, M Blotenburg, J Vivié, P Baillie-Johnson, J Nichols, KF Sonnen, A Martinez Arias, A v Oudenaarden

Nature

Download|2020

Generating gastruloids with somite-like structures from mouse embryonic stem cells

V v Batenburg, SC vd Brink, M Blotenburg, A Alemany, N Moris, P Baillie-Johnson, Y el Azhar, KF Sonnen, A Martinez Arias, A v Oudenaarden

ProtocolExchange

Download|2020

Modulation of phase-shift between Wnt- and Notch-signaling oscillations controls mesoderm segmentation.

Sonnen KF, Lauschke V, Uraji J, Falk H J, Petersen Y, Funk MC, Beaupeux M, François P, Merten CA and Aulehla A.

Cell 172: 1079-1090

Download|2018

Spatiotemporal analysis of a glycolytic activity gradient linked to mouse embryo mesoderm development.

Bulusu V, Prior N, Snaebjornsson MT, Kuehne A, Sonnen KF, Kress J, Stein F, Schultz C, Sauer U and Aulehla A.

Dev Cell 40: 331-341

Download|2017

Overige publicaties

Human Cep192 and Cep152 cooperate in Plk4 recruitment and centriole duplication.

Sonnen KF, Gabryjonczyk AM, Anselm E, Stierhof YD and Nigg EA.

J Cell Sci 126: 3223-3233

Download|20130501

Biology Open 1: 965-976

Download|20120501

Groepsleider

Katharina Sonnen

Katharina Sonnen is groepsleider bij het Hubrecht Institute. Haar groep bestudeert hoe biologische informatie robuust wordt overgedragen via signaalpaddynamiek in multicellulaire systemen. Ze concentreren zich op de rol van signaalpaddynamiek (1) tijdens ontwikkeling met behulp van muis-somitogenese als modelsysteem en (2) tijdens weefselhomeostase met behulp van intestinale organoïden als modelsysteem. De Sonnen-groep gebruikt technieken om de dynamiek van signaleringsroutes te verstoren en kwantitatief te analyseren. Ze hebben een microfluïdisch systeem opgezet om de intercellulaire signalering in multicellulaire systemen dynamisch te moduleren. Bovendien vullen ze die tools aan met biochemische en celbiologische technieken om het mechanisme van dynamische signaalcodering op moleculair niveau te ontrafelen.

Wetenschappelijke training en posities

Prijzen en fellowships


Groepsleden

Katharina Sonnen

Group Leader

Wouter Thomas

Technician

Yasmine el Azhar

PhD Student

Sonja Weterings

PhD Student

Marek van Oostrom

PhD Student

Joris Geigenmüller

Student

Tjerk Swinkels

Student

Wilke Meijers

Student

Karin Jansen

Guest

Show all group members

Vacatures voor PhD students en PostDocs

 

Posities voor Master students

Video's