Tanenbaum: Dynamiek van genexpressie

Terug naar onderzoeksgroepen

De Tanenbaum groep gebruikt innovatieve ‘single-molecule’ microscopie methodes en nieuwe methodes van genetische modificaties om met zeer hoge resolutie regulatie van gen expressie te bestuderen in levende cellen.

Met ons onderzoek willen we begrijpen hoe de regulatie van genexpressie belangrijke intracellulaire beslissingen beïnvloedt in gezonde en zieke cellen. Wij focussen ons zowel op regulatie van  menselijke genen, als ook op regulatie van gen expressie van verschillende RNA virussen. Daarnaast ontwikkelen we nieuwe imagingtechnieken om continu de grens te verleggen van in vivo moleculaire analyses.

We zoeken mensen voor verschillende functies!!!
–> Meer informatie te vinden onderaan deze pagina

Figuur 1. Single-molecule imaging van mRNA-translatie met behulp van het SunTag-systeem. (A) Schema van de SunTag-fluorescentielabelstrategie. (B) Imaging van individuele mRNA-moleculen in levende cellen.

Moleculaire analyse van genexpressie in levende cellen

Een aantal jaar geleden hebben wij een nieuwe imagingtechniek ontwikkeld: “SunTag” (Tanenbaum et al., 2014, Cell). Hiermee kunnen we een groot aantal GFP’s koppelen aan een eiwitmolecuul dat we willen onderzoeken (figuur 1A). Deze GFP-multimerisatie benadering maakt de fluorescentie labels veel helderder dan voorheen mogelijk was, en stelt ons in staat om complexe biologische processen met een gevoeligheid van individuele moleculen in real-time in levende cellen te visualiseren. Met behulp van de SunTag-technologie kunnen we de translatie van afzonderlijke mRNA moleculen in ruimte en tijd continu volgen (figuur 1B; Yan et al., 2016, Cell).

Key publications

Translation and Replication Dynamics of Single RNA Viruses

Boersma S, Rabouw HH, Bruurs LJM, [...] van Kuppeveld F*, Tanenbaum ME*

Cell: 183, 1–16

Download|2020

Single-molecule imaging uncovers rules governing nonsense-mediated mRNA decay

Hoek TA*, Khuperkar D*, Lindeboom RGH, [...] Tanenbaum ME

Molecular Cell 75(2):324-339

Download|2019

Multi-color single-molecule imaging uncovers extensive heterogeneity in mRNA decoding

Boersma S*, Khuperkar D*, Verhagen BMP, [...] Tanenbaum ME

Cell 178(2):458-472

Download|2019

Dynamics of translation of single mRNA molecules in vivo.

Yan X, Hoek TA, Vale RD and Tanenbaum ME.

Cell; 165(4):976-89

Download|2016

mRNA structural dynamics shape Argonaute-target interactions

Ruijtenberg S*, Sonneveld S*, Cui TJ, [...] Tanenbaum ME

Nat Struct Mol Biol. 28(6):533

Download|2020

A public-private partnership model for COVID-19 diagnostics

Krijger PHL*, Hoek TA*, [...] de Laat W#, Tanenbaum ME#

Nat Biotechnol. 39(10):1182-1184

Download|2021

Groepsleider

Marvin Tanenbaum

Marvin Tanenbaum is groepsleider bij het Hubrecht Institute. Zijn groep bestudeert de moleculaire mechanismen achter de controle van genexpressie op het niveau van individuele cellen, en onderzoekt hoe deze controle van genexpressie belangrijke cellulaire beslissingen beïnvloedt. De Tanenbaum groep heeft verschillende nieuwe technieken ontwikkeld, zoals het SunTag-fluorescentie-imagingsysteem. Hiermee kunnen ze individuele mRNA-moleculen visualiseren en kwantificeren, zodat ze de dynamiek en regulatie van elk individueel mRNA-molecuul in realtime kunnen bestuderen. SunTag is daarnaast aangepast om te fungeren als een kunstmatige transcriptiefactor, waarmee de genexpressie van endogene genen nauwkeurig kan worden gemoduleerd.

Wetenschappelijke opleiding en posities

Prijzen


Groepsleden

Marvin Tanenbaum

Group Leader

Leonie Apperloo

Technician

Lucas Bruurs

Postdoc

Rupa Banerjee

Postdoc

Huib Rabouw

Postdoc

Dhanushika Ratnayake

Postdoc

Sora Yang

Postdoc

Jet Segeren

Postdoc

Bram Verhagen

PhD Student

Max Madern

PhD Student

Iris Bally

PhD Student

Micha Müller

PhD Student

Janin Schokolowski

PhD Student

Demi van der Galiën

MSc Student

Marloes van Drimmelen

MSc Student

Srinaath Narasimhan

MSc Student

Marijn Kansen

MSc Student

Amke Hackmann

MSc Student

Matthijs Baars

Researcher

Show all group members

Lab alumni

Open positions

Open positions for Master Students

Tools and reagents

Video's