Tanenbaum: Dynamiek van genexpressie

Terug naar onderzoeksgroepen

De Tanenbaum groep gebruikt nieuwe manieren van live-cell moleculaire microscopie en nieuwe genetische technieken om de moleculaire mechanismen van genexpressie te onderzoeken.

Met ons onderzoek willen we begrijpen hoe de regulatie van genexpressie belangrijke intracellulaire beslissingen beïnvloedt. Daarnaast ontwikkelen we nieuwe imagingtechnieken om de grens te verleggen van in vivo moleculaire analyses en gebruiken we deze om nog dichterbij een mRNA-molecuul te komen.

Figuur 1. Single-molecule imaging van mRNA-translatie met behulp van het SunTag-systeem. (A) Schema van de SunTag-fluorescentielabelstrategie. (B) Imaging van individuele mRNA-moleculen in levende cellen.

Moleculaire analyse van genexpressie in levende cellen

Onlangs hebben wij een nieuwe imagingtechniek ontwikkeld: “SunTag” (Tanenbaum et al., 2014, Cell). Hiermee kunnen we een groot aantal GFP’s koppelen aan een eiwitmolecuul dat we willen onderzoeken (figuur 1A). Deze GFP-multimerisatiebenadering maakt de fluorescentielabels veel helderder dan voorheen mogelijk was, en stelt ons in staat om complexe biologische processen met een gevoeligheid van individuele moleculen in realtime in levende cellen te visualiseren. Met behulp van de SunTag-technologie kunnen we de translatie van afzonderlijke mRNA-moleculen in ruimte en tijd continu volgen (figuur 1B; Yan et al., 2016, Cell).

Key publications

Combined CRISPRi/a-based chemical genetic screens reveal that rigosertib is a microtubule-destabilizing agent.

Jost M, Chen Y*, Gilbert LA*, Horlbeck MA*, Krenning L*, Menchon G*, Rai A*, Cho MY, Stern JJ, Prota AE, Kampmann M, Akhmanova A, Steinmetz MO, Tanenbaum ME# and Weissman JS#.

Mol Cell 68(1):210-223.e6

Download|2017

# Corresponding authors

Dynamics of translation of single mRNA molecules in vivo.

Yan X, Hoek TA, Vale RD and Tanenbaum ME.

Cell; 165(4):976-89

Download|2016

Regulation of mRNA translation during mitosis.

Tanenbaum ME, Stern-Ginossar N, Weissman JS and Vale RD.

eLife 25;4

Download|2015

Activation of cytoplasmic dynein motility by dynactin-cargo adapter complexes.

McKenney RJ, Huynh W, Tanenbaum ME, Bhabha G and Vale RD.

Science 345(6194):337-41

Download|2014

Cell 159:635–646

Download|2014

Groepsleider

Marvin Tanenbaum

Marvin Tanenbaum is groepsleider bij het Hubrecht Institute. Zijn groep bestudeert de moleculaire mechanismen achter de controle van genexpressie op het niveau van individuele cellen, en onderzoekt hoe deze controle van genexpressie belangrijke cellulaire beslissingen beïnvloedt. De Tanenbaum groep heeft verschillende nieuwe technieken ontwikkeld, zoals het SunTag-fluorescentie-imagingsysteem. Hiermee kunnen ze individuele mRNA-moleculen visualiseren en kwantificeren, zodat ze de dynamiek en regulatie van elk individueel mRNA-molecuul in realtime kunnen bestuderen. SunTag is daarnaast aangepast om te fungeren als een kunstmatige transcriptiefactor, waarmee de genexpressie van endogene genen nauwkeurig kan worden gemoduleerd.

Wetenschappelijke opleiding en posities

Prijzen


Groepsleden

Marvin Tanenbaum

Group Leader

Ive Logister

Technician

Suzan Ruijtenberg

Postdoc

Deepak Khuperkar

Postdoc

Lenno Krenning

Postdoc

Tim Hoek

PhD Student

Stijn Sonneveld

PhD Student

Sanne Boersma

PhD Student

Bram Verhagen

PhD Student

Emmy Wesdorp

Student

Tonja Pavlovic

Student

Max Madern

Student

Lotte Burgering

MSc Student

Loes Steller

MSc Student

Maarten Dirkzwager

MSc Student

Lab alumni

Open positions for PhD students and Postdocs

Open positions for Master Students

Video's

Job openings

Postdoc

Research group

Tanenbaum groep

Start date

Asap

Locatie

Utrecht Science Park

Period

Voltijd

PhD Student

Research group

Tanenbaum groep

Start date

Asap

Locatie

Utrecht Science Park

Period

Deeltijd