Over Ons
Onderzoeksgroepen
Vrienden
Onderzoekers bij het Hubrecht Institute kunnen gebruik maken van een moderne onderzoeksinfrastructuur, waarmee ze hoge doelen kunnen stellen. De faciliteiten worden beheerd door bekwame analisten en worden aangepast aan de behoeften van de onderzoekers.
Imaging wordt steeds belangrijker in de biomedische wetenschappen en het onderzoek bij het Hubrecht Institute. Om te voldoen aan de groeiende vraag naar imaging-apparatuur is in 2009 het Hubrecht Imaging Center (HIC) opgericht. Het Hubrecht Institute heeft de laatste jaren verschillende geavanceerde microscopen aangeschaft, die nu onder de verantwoordelijkheid van het HIC vallen.
Het HIC assisteert bij eenvoudige fase-contrast-imaging tot imaging van levend weefsel in hoge resolutie. Geavanceerde systemen die beschikbaar zijn bij het HIC zijn confocale, twee-foton- TIRF-, FRAP- en FRET (inclusief FLIM)-microscopie. Het imaging center heeft niet alleen moderne imagingsystemen in zijn beheer; ook enkele historische microscopen zijn behouden.
Wetenschappers bij het Hubrecht Institute gebruiken imaging om intra- en extracellulaire processen in de tijd te volgen. Intravitale microscopie stelt hen bijvoorbeeld in staat om de adaptieve processen van cellen te visualiseren in levende dieren. Deze techniek maakt biologische processen inzichtelijk, om bijvoorbeeld bij muizen individuele tumorcellen voor een aantal weken te volgen op subcellulair niveau. Geavanceerde microscopietechnieken kunnen ook inzicht bieden in processen zoals mitose en chromosomale instabiliteit.
Het HIC verzekert onderzoekers ervan dat de geavanceerde imagingapparatuur van het Hubrecht Institute goed functioneert en optimaal wordt gebruikt. Dat gebeurt door alle systemen periodiek te testen en te optimaliseren, nieuwe onderzoekers te trainen en ondersteuning te bieden bij imagingexperimenten.
Bij single-cell-analyse wordt de sequentie-informatie van individuele cellen bestudeerd.
Elke normale humane cel bevat ongeveer 6 miljard basenparen aan DNA, ook wel bekend als het genoom. De expressie van dit genoom is anders in iedere humane cel. Door middel van de productie van verschillende eiwitten geven verschillende levels van genexpressie elke cel zijn specifieke karakteristieken en functies. Deze genexpressie kan worden gemeten door het analyseren van RNA, de moleculen die worden getranscribeerd van het DNA en die de genetische informatie doorgeven aan het ribosoom, waar de eiwitproductie plaatsvindt.
Om de regulatie van patronen in de genexpressie te begrijpen en analyseren, wordt kwantitatieve RNA-sequencing gebruikt. Voor het bepalen van expressieniveaus op de traditionele manier is een mix van miljoenen cellen nodig. Maar die informatie is samengevoegd, waardoor het ontbreekt aan een resolutie die hoog genoeg is om conclusies te trekken over individuele cellen.
Met single-cell-analyse bestuderen onderzoekers de sequentie-informatie van individuele cellen. Dat leidt tot een hogere resolutie van data, waarmee uitspraken kunnen worden gedaan over de expressiepatronen van individuele cellen. Door daarnaast de expressiedata samen te voegen van meerdere individuele cellen, kunnen de eigenschappen van cellen in hun context worden bestudeerd. Door bijvoorbeeld individuele cellen uit een tumor te analyseren, kunnen onderzoekers uitspraken doen over de heterogeniteit van tumorweefsel. Op grotere schaal kan een overzicht van alle celsoorten uit een orgaan leiden tot meer inzicht in expressieprofielen en de manier waarop deze cellen zich gedragen in dat orgaan. Een van de projecten die hieraan bijdragen is de Human Cell Atlas. De analyse van individuele cellen kan zo bijdragen aan een beter begrip van de menselijke gezondheid, diagnosticeren en monitoren, en het ontwikkelen van gepersonaliseerde behandelingen.
In navolging op het groeiende aantal projecten rond single-cell-sequencing richtte het Hubrecht Institute in juli 2016 de Single Cell Sequencing Facility op. Deze faciliteit ondersteunde onderzoeksgroepen van binnen en buiten het Hubrecht Institute met kennis en apparatuur voor onderzoek op het gebied van individuele cellen van juli 2016 tot juni 2018. In juni 2018 opende het spin-off bedrijf Single Cell Discoveries zijn deuren om te kunnen voorzien in de voortdurend groeiende vraag naar single cell sequencing experimenten vanuit de wetenschappelijke gemeenschap wereldwijd.
De Flow Cytometry Core facility biedt gebruikers van het Hubrecht Institute, het UMC Utrecht en het Prinses Máxima Centrum moderne apparatuur voor flowcytometrie en het sorteren van cellen. De faciliteit wordt continu uitgebreid met nieuwe software en apparatuur, die onderzoekers de mogelijkheid bieden om cellen te sorteren en analyseren volgens maximaal 18 fluorescente parameters.
De Flow Cytometry Core facility is beschikbaar voor:
Het Hubrecht Institute heeft zijn eigen dierenfaciliteit, waarin rondwormen (Caenorhabditis elegans), fruitvliegen (Drosophila melanogaster), zebravissen (Danio rerio) en kikkers (Xenopus laevis) leven. Daarnaast heeft de faciliteit knaagdieren onder zijn hoede, zoals muizen, stekelmuizen en ratten.
Wanneer dit mogelijk is worden dierexperimenten vervangen door in vitro-modellen, zoals organoïden. Daarmee wordt het aantal proefdieren verminderd. Op de wetenschappelijke experimenten waarbij een vervangend model niet mogelijk is, is continu toezicht. Het aantal dierexperimenten wordt daarmee verfijnd en beperkt tot een minimum. Op alle dierexperimenten bij het Hubrecht Institute is de gebruikelijke Nederlandse wetgeving van toepassing.
Tevens heeft De Koninklijke Nederlandse Akademie van Wetenschappen, waar het Hubrecht Instituut onderdeel van is, de Nederlandse Transparantieovereenkomst dierproeven ondertekend. Meer informatie over deze overeenkomst is hier te vinden.
Naast de faciliteiten die het Hubrecht Institute zelf heeft, biedt de omgeving van het Utrecht Science Park meer dan 50 gedeelde faciliteiten. Deze kunnen worden gebruikt door alle onderzoekers die daar werken. Een overzicht van alle beschikbare faciliteiten op het Utrecht Science Park staat op de website van Utrecht Life Sciences.
