Kind: Chromatine-verdeling

Terug naar onderzoeksgroepen

De Kind groep bestudeert de regulatie van genexpressie in individuele cellen door middel van het ontwikkelen van nieuwe technieken gebaseerd op microscopie en genomica.

Het genomische tijdperk heeft ons begrip van cellulaire processen en ziektemechanismen sterk vergroot. Toch is onze kennis over genoomregulatie gebaseerd op datasets van grote celpopulaties, die ons alleen een gemiddelde interpretatie geven van het biologische systeem en bestaande cel-cel-heterogeniciteit niet meerekenen.

Om moleculaire processen in individuele cellen te ontrafelen en de volledige complexiteit van biologische systemen te begrijpen, passen wij nieuwe microscopie- en genomics-gebaseerde technieken toe en ontwikkelen wij deze, zodat we de regulatie van genexpressie in afzonderlijke cellen kunnen bestuderen. We hebben een hulpmiddel ontwikkeld om de genoomarchitectuur in levende cellen in beeld te brengen en, recentelijk, een methode om DNA-eiwitinteracties met hoge resolutie in afzonderlijke cellen te profileren. Met deze technieken willen we duidelijk maken wat de rol is van genoomarchitectuur en chromatinecontext in het reguleren van de temporele en spatiale controle van genexpressie bij ontwikkeling en ziekte.

Key publicationsView all publications

Nature Methods 21:72–82

Download|2023

Single-cell profiling of transcriptome and histone modifications with EpiDamID

Rang FJ, de Luca, KL, de Vries SS [...] Kimura H, Bakkers J and Kind J

Molecular Cell 82: 1-15

Download|2022

Nature Protocols 6:1922-1953.

Download|2020

Nature Biotechnology 37:766-772

Download|2019

Genome–lamina interactions are established de novo in the early mouse embryo

Borsos M, Perricone SM [...] Torres-Padilla M and Kind J

Nature 569: 429-433

Download|2019

Curr Opin Genet Dev 55:19-25

Download|2019

Genome-wide maps of nuclear lamina interactions in single human cells.

Kind J, Pagie L [...] van Oudenaarden A and van Steensel B

Cell 163: 134-147.

Download|2015

Single-cell dynamics of genome-nuclear lamina interactions.

Kind J, Pagie L [...] Bickmore WA and van Steensel B

Cell 153: 178-192.

Download|2013

Cell 133: 813-828.

Download|2008

Groepsleider

Jop Kind

Jop Kind is groepsleider bij het Hubrecht Institute, bijzonder hoogleraar Eencellige Epigenomica aan de Radboud Universiteit Nijmegen en Oncode Investigator. Zijn groep onderzoekt de rol van chromatine en de architectuur van de celkern bij genregulatie en DNA-reparatie in gezonde en zieke cellen. De Kind groep ontwikkelt nieuwe technieken zoals de DamID and m6ATracer-technieken. Hiermee kunnen de onderzoekers genoomarchitectuur en eiwit-DNA-interacties bestuderen, in hoge resolutie en bij individuele cellen, uitgezet tegen tijd en ruimte van genexpressie.

Wetenschappelijke opleiding en posities

Prijzen


Groepsleden

Jop Kind

Group Leader

Sandra de Vries

Technician

Carla Kroon-Veenboer

Technician

Isabel Guerreiro

Postdoc

Christian Valdes

Postdoc

Robin van der Weide

Postdoc

Moritz Bauer

Postdoc

Isabel Sierra

Postdoc

Carlota Davo Martinez

Postdoc

Samy Kefalopoulou

PhD Student

Pim Rullens

PhD Student

Hidde Verhage

PhD Student

Marta Moreno Gonzalez

PhD Student

Lisa Sackmann

PhD Student

Vina My Pham

MSc Student

Kim de Luca

Guest

Franka Rang

Guest

Silke Lochs

Guest

Show all group members

We are always on the lookout for enthousiastic colleagues. If you are interested, please contact Jop Kind.